陆军的问题比较容易解决，毕竟一个陆军士兵你训练三个月或者一年都能练出一个水平出来，但是海军之类技术兵种，却不是如陆军那样操作那么简单。阿方索在结束后对伯爵军营的视察后，就一直考虑这个问题。
海军要求战舰的性能，水手的军事技能和训练有素的炮手，最后就是优秀的指挥官，各种因素相辅相成，从而让军舰成为一种强大的海军利器。而其中有相当部分，是西班牙欠缺的，虽然在亡羊补牢，但是也不是一两年就出结果的。用法国做一个例子，七年战争法国海军几乎破灭，舒瓦瑟尔整整建设十五年，才把法国海军从谷底拉起来。
法国大革命对于欧洲地缘的改变在陆地上还不明显，但是在海上却是实打实巨大冲击，西班牙已经能够感受到。
北美战争期间，欧陆各国结合在一起反对七年战争后英国海军霸权，法国，西班牙和荷兰组建大同盟支持美国的独立；俄罗斯，普鲁士，瑞典和葡萄牙组建武装中立同盟，为大同盟运送军用物资。英国第一次在欧洲大陆没有一个朋友支持他的战争，最后于1783年英国认输，英国独大的海权遭到了抑制。
战后，法国和西班牙抱团，世界第二和第三的海军大国，组成一个和英国不相伯仲的海上同盟，不仅是现役，考虑波旁同盟的船坞保存有主力战舰数量（81+75=156）超过英国船坞主力舰数量（146），双方维持双方海上力量的动态平衡。
只不过这个平衡，伴随着法国财政危机和大革命爆发后波旁权力旁落，出现了很大的偏移，虽然没有灾难性崩塌，但是也让危机意识的西班牙感觉到。
1789年的下半年，勒阿弗尔、布雷斯特、罗什福尔和土伦等所有法国海港城镇都受到王权崩塌的鼓舞。不务正业或遭受处罚的士兵们心怀不满，跑到市政厅抱怨他们的贵族军官。
波旁王朝海军大多都是从法国皇家海军学院专业学员中提拔出来的，他们大多是来自布列塔尼和普罗旺斯的贵族，敌视贵族的市政厅当局粗暴敢于舰队事物，指手画脚。因为巴黎制宪议会对于贵族的不信任，造成那些海军基地的贵族将官的正当权益无法得到伸张，只能一味向闹事的士兵妥协，而造成事态进一步恶化。
11月的土伦事件可以看作是法国海军的缩影，驻土伦的舰队司令里奥斯准将为了维持军纪，将试图煽动兵变的下级平民军官赶下了船。
这两人根本就没有反省，而是直接跑到市政厅，公开武装，借助群众还有一部分城市国民自卫队对于贵族的敌视态度，他们直接包围了里奥斯准将在土伦的府邸，土伦市长请求他原谅这两名下级军官，里奥斯准将被迫屈服，然而事情还没有结束。
第二日群众就指控有两名军官涉嫌命令海军炮手向暴动的民众开火，里奥斯准将驳斥了指控，但是群众不信任全是大部分的贵族海军军官。里奥斯准将却在这个问题上异常的坚决，不用说，怒气的民众直接将他枪杆殴打，拖出去游街示众。要不是因为里奥斯准将因为高尚的个人操守和慷慨仁厚，一些有理智的人保全他，将他关入普通监狱，而他那位副司令就没那么幸运，成为替罪羊被送上了绞刑架。
而巴黎制宪议会仅仅是一句“卷入事件的海军军官、市政官员和国民自卫队的动机都持肯定态度”而匆匆画上句号。
作为曾经和法国海军一同在北美战争作战的西班牙很多海军将官，都对于里奥斯准将遭受到的个人歧视和侮辱都十分愤慨。作为在1782年圣基茨岛海战唯一受到英法海军界一致好评的舰长，他们认为这样一个优秀的海军人才不该得到不公平的待遇。
“很显然，法国海军军官已经无法在依靠地方当局的支持，也不能指望法国政府，他们不再受到法律的保护，那些暴乱者完全违背了巴黎自己通过的公民权法令，而巴黎竟然视而不见。虽然法国战舰已经数量规模世界第二，但是指挥层面出现严重的差错，水手不服军官，恐怕对于法国海军的战力会减弱。”海军大臣巴蒂斯特·柯尔伯悲观地说道，不同于路易十六对于海军建设的重视，制宪议会的倒行逆施，必然会让法国海军步入路易十五时期的后尘。
“恐怕明年会更糟糕吧，都已经快年末了。法国制宪议会一直没有通过新税来弥补他们的财政漏洞，反而废除波旁时期法国的那些杂税。看着吧，明年法国海军状况会更加糟糕，这已经不是减弱那么简单，我严重怀疑那个时期的法国海军是否有可持续作战的力量。”阿方索一想到后世革命的法国海军一直被英国人压着打，可能一开始的问题就出在这里。
不过本着“死道友不死贫道”，有着历史上法国人冲在革命战争的最前线，吸引来自英国人海军的火力，西班牙至少还有一段相当长的空窗期来整治一下自家海军的力量。
同其他政府部门一样，西班牙海军也在阿方索“专业改革”中受到影响，一些没有用的贵族养老部门被裁汰，海军建立一个良好的制度环境并进行日常炮术和远洋训练。
对于海军的技术的更新，阿方索一直要求西班牙紧跟英国，谁叫英国人海军创新在所有欧洲海军国家里最多的。1782年的圣基茨岛海战，法国西印度舰队司令的德格拉斯就曾在日记中提到有关几艘英国军舰在他们的甲板上配备有臼炮“这些新武器的作用在滑膛枪射程内杀伤力巨大，4月12日让我蒙受严重的损失。”后来阿方索认证，那是英国人的卡隆炮。为此，因为之前不想花钱的西班牙风范战列舰都被阿方索要求回炉进行一番甲板的改造，至于钱的问题，就在明年的预算上。
不过那些波旁海军人才被法国现政府放弃，也是一个浪费。他们大多参与过北美战争，真是西班牙海军需要的人才，再不济也可以去海军学院教书。阿方索想到这里，伊瓦涅斯的第一任务有着落了。