解决掉神秘组织首领，陈凡和队员们马不停蹄地向着神秘组织总部的核心密室进发。一路上，神秘组织残余势力负隅顽抗，但在联军强大的攻势下，根本不堪一击。
终于，他们来到了核心密室的入口。巨大的石门紧闭，散发着冰冷的金属光泽。伊泽瑞尔迅速拿出携带的破解装置，开始对石门的锁闭系统进行分析破解。时间一分一秒过去，紧张的氛围愈发浓烈，所有人都屏气敛息，生怕错过任何突发状况。
“找到了！”伊泽瑞尔突然低喝一声，随着一阵机械运转声，石门缓缓打开。一股陈旧而邪恶的气息扑面而来，密室中弥漫着诡异的暗红色光芒。
踏入密室，众人看到一个巨大的能量核心装置，散发着令人胆寒的黑暗能量波动，四周连接着密密麻麻的管线，延伸至密室的各个角落。而在能量核心旁边，矗立着一座古老的石碑，上面刻满了奇怪的符号和图案。
艾丽娅走近石碑，伸出手轻轻触摸，瞬间，她的脑海中涌入大量信息。她脸色变得煞白，声音颤抖地说道：“这股古老的邪恶力量，源于宇宙诞生之初的黑暗本源。神秘组织企图利用它，打破宇宙的平衡，重塑一个由他们统治的黑暗宇宙。”
陈凡眉头紧锁，意识到了事态的严重性。“必须立刻摧毁这个能量核心，绝不能让他们的阴谋得逞。”
就在众人准备行动时，密室突然剧烈震动起来。能量核心装置疯狂运转，黑暗能量如汹涌的潮水般四溢而出，在密室中凝聚成一个个黑暗幻影。这些幻影形态各异，却都散发着强烈的敌意和强大的力量。
其中一个身形巨大的黑暗幻影挥舞着手臂，一道道黑色闪电向着众人劈来。莱昂纳德反应迅速，驾驶先锋战机瞬间升空，发射导弹将黑色闪电一一拦截。伊泽瑞尔操作手中的武器，不断攻击黑暗幻影，试图找出它们的弱点。
露西亚则开启防护屏障，为队友们提供保护，同时施展净化之力，驱散不断逼近的黑暗能量。陈凡和艾丽娅并肩作战，陈凡凭借自身强大的战斗能力，与黑暗幻影近身搏斗；艾丽娅引导暗影神器，将神器的净化能量注入陈凡的武器，增强攻击力。
然而，黑暗幻影源源不断地涌出，联军逐渐陷入了苦战。更糟糕的是，能量核心装置的运转速度越来越快，黑暗能量的爆发已经到了失控的边缘。一旦核心爆炸，整个宇宙都将陷入万劫不复之地。
陈凡心急如焚，他一边奋力抵挡黑暗幻影的攻击，一边思索着应对之策。突然，他脑海中灵光一闪，想到了一个冒险的计划。
“艾丽娅，你尝试用暗影神器的力量，稳定能量核心的波动。其他人全力攻击黑暗幻影，为艾丽娅争取时间！”陈凡大声喊道。
艾丽娅深吸一口气，集中精神，将暗影神器的力量发挥到极致，缓缓靠近能量核心。黑暗幻影察觉到她的意图，疯狂地向她发起攻击。莱昂纳德、伊泽瑞尔和露西亚三人紧密配合，组成防线，为艾丽娅保驾护航。
艾丽娅的额头布满汗珠，双手微微颤抖，但她始终没有放弃。终于，在她不懈的努力下，暗影神器的净化能量与能量核心的黑暗能量产生了共鸣，核心的波动逐渐趋于稳定。
与此同时，陈凡抓住黑暗幻影出现短暂空隙的时机，发动了全力一击。他将体内所有的能量汇聚在手中的武器上，发出一道耀眼的光芒，瞬间摧毁了大部分黑暗幻影。
随着黑暗幻影的消散，能量核心也逐渐停止了疯狂运转。但众人还来不及松一口气，就发现能量核心中出现了一个新的危机——能量核心内部的稳定结构被之前的剧烈波动破坏，随时可能发生小型的连锁爆炸，虽然不会摧毁宇宙，但足以将他们所在的这片区域化为灰烬。