刘进忠得到报告，四军主将椿树湾中了明军的计策伤亡惨重，大败而回，大批的明军已经杀到城下。
刘进忠大惊，战场上真是瞬息万变，刚才不是大西军攻进了明军的大营，明军被杀得大败，怎么转眼之间就有如此惨败？
很快，刘进忠明白了。李自成制造了兵变，鸡鸣山上劫粮肯定不会成功。想让明军首尾难顾已经成为奢望，椿树湾的明军大营本来就是朱由崧故意露出的破绽，在这种情况下四军主将不败等什么呢？
刘进忠不敢再追杀李自成了，现在他调动的人马全都是守城的兵将。
按照张献忠事前的分工，刘进忠的主要任务是守住夔州城，保护皇宫，现在皇宫出了这么大的事，张献忠还没找他算账，如果夔州再丢了，张献忠非刨他的祖坟不可。
负责镇守夔州的大西军共有5万，除去守把皇宫的一万军队，实际上城防力量只有4万人，李自成制造了夔州兵变杀进了皇宫，刘进忠又紧急抽调了两万多人马，这样算来现在守城的人马不足两万人，这么大的夔州城一万多人如何守得住？
而且现在更要命的是，四军主将带着残兵败将大败而回，明军紧追不舍，尾随而至，明军士气正盛，大西军军心涣散。
还有北城门现在尚未夺回，李自成这几千人马也不是好对付的，虽然他们只有4000人左右，李自成悍猛，李过，高一功，袁宗第，刘芳亮，田见秀，皆是万人敌。
因此刘进忠权衡利弊之后，决定不再追击李自成了，必须得纠集人马守住夔州城。
因此刘进忠指挥着人马打算上城守城。
现在四军主将带回来的人马也不知道有多少，在椿树湾明军大营，前军主将王定国遇到了马金花，王定国挨了一枪，已经死在乱军之中。现在四军主将逃回夔州城的只有中军主将王尚礼，左军主将马元利和右军主将张化龙。
等这三员主将纠集残部在刘进忠的人马屁股后面准备上城守城的时候，已经晚了。
李柱石的炮营压制住城头城的火力之后，守城的人马来来回回，增增减减，军心早已浮动，有的指挥混乱，一会儿东一会儿西，弄得这些守城的兵将晕头转向，不知道该听谁的，不少军将骂骂咧咧挤在一起，还没到指定的地点便被炸得稀烂，有的干脆趁着混乱逃命了。
因此李柱石的炮营停止攻击之后，大批的明军一鼓作气便攻上城头。
大西军刚刚在椿树湾吃了败仗，也不知道又明军又冲上来多少，因为这是黑天，到处是火把，喊杀声震天动地，大西军军心大散，兵无斗志，这些残兵败将很大一部分是在逃命，因此明军很快攻入城中。
从明军开始攻城到大批的军队攻入城中，只用了一顿饭的时间。这可以说是朱由崧的军队攻城最快的一次，称得上是闪电战，对固若金汤的夔州城，简直是一种讽刺。
此时城中的大西军队并不少，如果数一数，应该不会少于10万，但是再多的人马军心浮动，指挥不灵也形不成战力，这就像是人没了精神，军队没有了军魂，只能干吃败仗，任人宰割。
刘进忠一看夔州是守不住了带着一支人马，退下城头，火急火燎的来见张献忠：“陛下，城破了，微臣有罪，先让微臣护驾离开夔州这是非之地，然后臣再领罪。”
张献忠闻言大怒，御医现在正在抢救他的爱妃李纳，李自成造反打乱了他的全盘计划，他也知道椿树湾一战必败，鸡鸣山劫粮也不会有结果，但是没想到夔州成这么快就破了，正愁没地方撒气呢，此时的刘进忠便成了他的出气筒。
“废物，留你何用？”张献忠一刀把刘进忠劈倒在地。
刘进忠身后的几名亲随兵将，在宫门口看到这一情景吓得差点尿裤，全都跪趴在地上，大气都不敢哈一声，他们的头儿刘进忠都死了，估计他们也得倒霉。
但是张献忠没有拿他们开刀，这也算是法不责众吧，另外，张献忠不能把自己的人都杀了，非常时期正在用人，那样谁来护驾呢？
杀一个罪魁祸首刘进忠出口恶气就行了，其实刘进忠成为替罪羊并不冤，皇宫他守不住，夔州城他还守不住，难怪张献忠要拿他开刀了。
不过历史上的刘进忠可不是这样死的。
据记载，弘光帝政权灭亡以后，清军大举南下不久进图四川，清廷劝张献忠投降，张献忠不理不问，坚持抗清。张献忠御驾亲征西充凤凰山扎御营，广宁守将刘进忠率众投降了鞑子，背叛了张献忠当了可耻的汉奸。
刘进忠给清廷献计，导致凤凰山一战，张献忠大败，张献忠中箭落马，结束了他叱咤风云的一生。
现在由于朱由崧的穿越，不但改变了李自成的命运，也改变了张献忠的命运，这样刘进忠不但没有机会背叛张献忠投降鞑子当汉奸，反而被张献忠所杀，这也算是轮回报应吧。
张献忠杀完刘进忠之后，知道夔州城已经守不住了，让中军主将王尚礼护驾，带着已经脱离生命危险的李纳从南门仓皇出逃。
留下左军主将马元利和右军主将张化龙各率领本部马守城断后。明知道守不住了还让他们守城，其实张献忠就是让他们留下当炮灰，否则他没有机会逃跑。
马元利和张华龙不敢抗命，椿树湾一战，二将大败而回，损兵折将，张献忠没有治他们的罪，二将感念皇恩浩荡，现在让他们断后，无疑也是对他们的信任，也是将功补过的一个时机。
因此这二将毫无怨言，带着四万多人拼死力战，在夔州城内跟明军展开了巷战，以掩护他们的陛下张献忠撤退。
夔州激战一直杀到天亮，直到马元利和张华龙两员主将，双双死于乱军之中，剩余的万余大西军全部弃械投降，这场大战才宣告结束。
这天上午巳时过后，朱由崧在御营卫队的保护下，浩浩荡荡的开进了夔州城。