某日。
毛利小五郎在家看报，忽然听到了电话铃声。
他接通了电话，道：“喂！这里是毛利侦探事务所。”
“我是阿笠博士！毛利侦探。”对面传来的熟悉的声音。
毛利小五郎笑道：“阿笠博士吗？是找柯南吗？我去叫他。”
“不！啊！也不是。我是找你们两个，情形有些复杂，有个人来了我家，现在想要见你和新一。”阿笠博士道。
毛利小五郎道：“不是说了吗？别提那个名字，叫柯南就好了。”
他一直搞不懂，这阿笠博士，经常叫新一，这可不是好事，如果被人窃听，那就不好了。
“啊！习惯了，不好意思。”阿笠博士道。
他也知道不好，但见到柯南的时候，有时候总是忍不住叫出新一这个名字。
毛利小五郎道：“去你家的那人，是跟那个组织有关吗？”
“你怎么知道的？”阿笠博士惊讶道，他压根没提啊。
毛利小五郎道：“你平时很少找我，就算是找我，也会告诉我原因。但这次却是有所隐瞒，而且还带上了柯南。”
“我想我们三人的共同话题，恐怕也只有跟那个组织有关了。”
阿笠博士道：“毛利侦探，你不愧是名侦探啊！”
“好了！看样子在电话中说不清，我现在就带柯南过去。”毛利小五郎道，随后他就挂断电话。
毛利小五郎高声喊道：“小兰，柯南，你们过来一下！要去阿笠博士家一趟！”
“怎么了？爸？”毛利兰从厨房出来，问道。
柯南也是道：“发生了什么事？”
“应该是大事，上车再说。”毛利小五郎匆匆出门，毛利兰和柯南虽然一头雾水，但还是跟了上去。
车上。
柯南道：“毛利叔叔，可以说了吧？”
毛利小五郎没有隐瞒，一边开车，一边将刚才的事情道出。
“什么？跟黑衣组织相关的人？”柯南震惊不已。
毛利兰也是变得紧张，那是将工藤新一变小的邪恶组织，如果不是他们，新一根本不会变成这样。
毛利小五郎道：“冷静一点，我现在所知也有限，去到才能知道具体情况。”
“不过听阿笠博士的语气，应该没有什么危险。”
……
不久之后，他们就抵达了阿笠博士的家。
阿笠博士出门迎接道：“你们终于来了！小兰也来了吗？”
“博士，到底是怎么一回事？真的是和黑衣组织相关的人吗？”柯南焦急的问道。
毛利小五郎一把按住他的头，道：“冷静一点！毛毛躁躁的，对事情有半点帮助吗？”
“发生了那么多事情，还是这副模样，就算那个组织的人来了，你也对付不了，最后只会重蹈覆辙，栽在他们手中。”
柯南闻言，虽然依旧心急如焚，但勉强算是冷静下来。
阿笠博士道：“新一……”
他看到毛利小五郎狠狠地盯着他，改口道：“柯南，毛利侦探，还有小兰，你们都进来再说。”
进入阿笠博士的房子后，将门关上。
这个时候，一个小女孩现出身形。
阿笠博士道：“这个小女孩，跟黑衣组织有关，跟柯南一样，是吃了药后变小的。”
“什么？”柯南大吃一惊。
毛利小五郎和毛利兰也是感到惊讶，想不到还有另外一个返老还童的人。
那小女孩，一头茶色头发，瞧都不瞧柯南一眼，对毛利小五郎道：“毛利侦探，我姐姐她在哪里？！”
毛利小五郎挑眉道：“你姐姐？谁啊？难道是……宫野明美？”
他脑子中不断转动，想到的跟黑衣组织有关的女子，也只有宫野明美。
而且宫野明美虽然落网了，但是出于保护宫野明美，警方动用了证人保护措施，给了她一个新的身份，在安全的地方隐居。
“没错！她就是我的姐姐。”茶色头发少女道。
毛利小五郎盯着她，道：“你觉得我会轻易告诉你吗？你还没有自我介绍呢！不过，我可以先告诉你，她现在是安全的。”
茶发少女心中一松，道：“我叫做宫野志保，也是黑衣组织的成员，代号叫做雪莉。”
“宫野明美是我的姐姐，因为我负责药物研究，所以我和姐姐长期分开，我有一段时间没有和她联络了，组织的人也不允许。”
“我因此拒绝为他们工作，组织对我的监视变得更为严格，后来听说监视我的两个成员死了，换了监视我的成员。”
“他们对我拒绝工作感到愤怒，想要除掉我。”
“我只好冒险吃了那个药，变小后逃了出来。”
毛利小五郎道：“你怎么找到这里的？”
“我是倒在了工藤新一家门口，被这位博士发现的。”宫野志保道。
柯南一惊道：“你说我家门口？”
“你知道吗？组织曾两次派人到你家调查。因为吃了那个药的人当中，只有你没被确定死亡。”宫野志保道。
“身为该药发明者的我，当然也一起前往。”
“什么？”柯南一惊，怒道：“那毒药是你发明的？！”
毛利小五郎一把按住柯南，道：“好了！柯南你就先别问，等她说完行吗？那药的发明者都在这里，你还紧张个什么？！”
宫野志保道：“我也不想发明毒药什么的……”
“当日我们到工藤新一家，房子里布满灰尘，没有任何人居住的迹象，所以第一次就此告一段落。”
“第二次调查是在一个月后，屋里依旧灰尘弥漫，毫无改变。”
“就在我也开始觉得你已死亡时，正好注意到衣柜里有异状。”
柯南道：“你是说我小时候的衣服？不应该啊！在毛利叔叔提醒后，我已经还回去了啊！”
“没错！但是你没有注意到，上面有新鲜的洗衣粉味道。”灰原哀道：“你小时候已经是多久了啊！”
“谁会给小时候的衣服，重新清洗啊！而且其他的衣服都没洗，就洗了小时候的衣服！”
毛利小五郎道：“竟然是这样暴露的吗？还真没有料到呢！”
“只能说，你的鼻子够灵！”
宫野志保道：“在做动物实验时，曾经有只小白鼠没死，并且退化成幼鼠，所以这个假设容易成立。”
“工藤新一在服下Aptx4869后，可能退化成了儿童。”
柯南神色大变，道：“那组织知道我变小的事了！”
宫野志保道：“感谢我吧！我在你的资料上填入了【确认死亡】。”
“你是我非常感兴趣的研究对象，所以我想让你活着。”
“如果向组织报告，你可能在送到我这之前就被杀害。”
“但如果他们知道改写资料的人，是背叛了组织的我之后，可能会再度开始怀疑。”